Découverte de la diversité génétique de Giardia intestinalis dans des isolats provenant d’épidémies en Nouvelle-Zélande | Maladies infectieuses de la pauvreté

  • Cacciò SM, Sprong H. Épidémiologie de la giardiase chez l’homme. Dans: Giardia. Vienne : Springer ; 2011. p. 17–28.

    Chapitre Google Scholar

  • Yaoyu F, Xiao L. Potentiel zoonotique et épidémiologie moléculaire de Giardia espèces et la giardiase. Clin Microbiol Rev. 2011 ; 24 : 110–40.

    Article Google Scholar

  • Einarsson E, Ma’ayeh S, Svärd SG. Une mise à jour sur Giardia et la giardiase. Curr Opin Microbiol. 2016 ; 34 : 47–52.

    Article Google Scholar

  • Tellevik MG, Moyo SJ, Blomberg B, Hjøllo T, Maselle SY, Langeland N, et al. La prévalence de Cryptosporidium parvum / hominis, Entamoeba histolytica et Giardia lamblia chez les jeunes enfants avec et sans diarrhée à Dar es Salaam, Tanzanie. PLoS Negl Trop Dis. 2015 ; 9 : e0004125.

    Article Google Scholar

  • Reh L, Muadica AS, Köster PC, Balasegaram S, Verlander NQ, Chércoles ER, et al. Prévalence importante d’entéroparasites Cryptosporidium spp., Giardia duodenalis et Blastocystis sp. chez des écoliers asymptomatiques à Madrid, Espagne, de novembre 2017 à juin 2018. Eurosurveillance. 2019 ; 2019 (24) : 1900241.

    Google Scholar

  • Robertson LJ, Hanevik K, Escobedo AA, Mørch K, Langeland N. Giardiase — pourquoi les symptômes ne s’arrêtent-ils parfois jamais ? Tendances Parasitol. 2010 ; 26 : 75–82.

    Article Google Scholar

  • Halliez MCM, Buret AG. Conséquences extra-intestinales et à long terme Giardia duodenalis infections. Monde J Gastroenterol. 2013 ; 19 : 8974–85.

    Article Google Scholar

  • Savioli L, Smith H, Thompson A. Giardia et Cryptosporidium rejoignez l’« Initiative contre les maladies négligées ». Tendances Parasitol. 2006 ; 22 : 203–8.

    Article du CAS Google Scholar

  • Ryan U, Hijjawi N, Feng Y, Xiao L. Giardia: un parasite d’origine alimentaire sous-déclaré. Int J Parasitol. 2019 ; 49 : 1–11.

    Article Google Scholar

  • Garcia-R JC, French N, Pita A, Velathanthiri N, Shrestha R, Hayman D. Diversité génétique locale et globale des parasites protozoaires : distribution spatiale des Cryptosporidium et Giardia génotypes. PLoS Negl Trop Dis. 2017 ; 11 : e0005736.

    Article Google Scholar

  • Cacciò SM, Lalle M, Svärd SG. Spécificité d’hôte dans le Giardia duodenalis complexe d’espèces. Infecter Genet Evol. 2017. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2017.12.001.

    Article PubMed Google Scholar

  • Haque R, Mondal D, Karim A, Molla IH, Rahim A, Faruque ASG, et al. Étude prospective cas-témoins de l’association entre les parasites protozoaires entériques communs et la diarrhée au Bangladesh. Clin Infect Dis. 2009 ; 48 : 1191–7.

    Article du CAS Google Scholar

  • Messa A, Köster PC, Garrine M, Gilchrist C, Bartelt LA, Nhampossa T, et al. Diversité moléculaire de Giardia duodenalis chez des enfants de moins de 5 ans du district de Manhiça, dans le sud du Mozambique, inscrits dans une étude cas-témoin appariée sur l’étiologie de la diarrhée. PLoS Negl Trop Dis. 2021 ; 15 : e0008987.

    Article Google Scholar

  • Xiao L, Feng Y. Outils épidémiologiques moléculaires pour les agents pathogènes d’origine hydrique Cryptosporidium spp. et Giardia duodenalis. Parasitol d’origine hydrique alimentaire. 2017 ; 8-9 : 14-32.

  • Efstratiou A, Ongerth JE, Karanis P. Transmission par l’eau des parasites protozoaires : examen des épidémies mondiales – une mise à jour 2011-2016. Eau Rés. 2017 ; 114 : 14-22.

    Article Google Scholar

  • Katz DE, Heisey-Grove D, Beach M, Dicker RC, Matyas BT. Éclosion prolongée de giardiase avec deux modes de transmission. Épidémiol Infect. 2006 ; 134 : 935–41.

    Article du CAS Google Scholar

  • Adam EA, Yoder JS, Gould LH, Hlavsa MC, Gargano JW. Éclosions de giardiase aux États-Unis, 1971-2011. Épidémiol Infect. 2016 ; 144 : 2790–801.

    Article du CAS Google Scholar

  • Plutzer J, Lassen B, Jokelainen P, Djurković-Djaković O, Kucsera I, Dorbek-Kolin E, et al. Examen de Cryptosporidium et Giardia dans la partie orientale de l’Europe, 2016. Eurosurveillance. 2018. https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2018.23.4.16-00825.

    Article PubMed PubMed Central Google Scholar

  • Snel SJ, Baker MG, Venugopal K. L’épidémiologie de la giardiase en Nouvelle-Zélande, 1997–2006. NZ Med J. 2009 ; 122 : 660.

    Google Scholar

  • Institut des sciences et de la recherche environnementales Ltd (ESR). Résumé annuel des épidémies en Nouvelle-Zélande 2017. Porirua : Institute of Environmental Science and Research Ltd (ESR) ; 2018.

    Google Scholar

  • Thompson R, Smith A. Protozoaires entériques zoonotiques. Vétérinaire Parasitol. 2011 ; 182 : 70–8.

    Article du CAS Google Scholar

  • Ortega-Pierres MG, Jex AR, Ansell BR, Svärd SG. Les progrès récents de la génomique et de la biologie moléculaire de Giardia. Acta Trop. 2018 ; 184 : 67–72.

    Article du CAS Google Scholar

  • Sarzhanov F, Köster PC, Dogruman-Al F, Bailo B, Dashti A, Demirel-Kaya F, et al. Détection des parasites entériques et caractérisation moléculaire des Giardia duodenalis et Blastocystis sp. chez des patients admis à l’hôpital d’Ankara, en Turquie. Parasitologie. 2021 ; 148 : 550–61.

  • Sarzhanov F, Dogruman-Al F, Santin M, Maloney JG, Gureser AS, Karasartova D, et al. Enquête sur les protistes négligés Blastocystis sp. et Dientamoeba fragilis chez les patients diarrhéiques immunocompétents et immunodéficients en utilisant à la fois des méthodes conventionnelles et moléculaires. PLoS Negl Trop Dis. 2021 ; 15 : e0009779.

  • Sécurité alimentaire de la Nouvelle-Zélande (MPI). Rapport annuel concernant les maladies d’origine alimentaire en Nouvelle-Zélande 2019. 2020.

  • Amplicon PC, Clean ‐ Up PC, Index PC. Préparation de la bibliothèque de séquençage métagénomique 16s. Illumina : San Diego, Californie, États-Unis. 2013.

  • Kearse M, Moir R, Wilson A, Stones-Havas S, Cheung M, Sturrock S, et al. Geneious basic : une plate-forme logicielle de bureau intégrée et extensible pour l’organisation et l’analyse des données de séquence. Bioinformatique. 2012 ; 28 : 1647–9.

    Article Google Scholar

  • Benson DA, Cavanaugh M, Clark K, Karsch-Mizrachi I, Lipman DJ, Ostell J, et al. GenBank. Nucleic Acids Res. 2013 ; 41 (D1) : D36–42.

  • Bolyen E, Rideout JR, Dillon MR, Bokulich NA, Abnet CC, Al-Ghalith GA, et al. Science des données reproductible, interactive, évolutive et extensible sur le microbiome utilisant QIIME 2. Nat Biotechnol. 2019 ; 37 : 852–7.

    Article du CAS Google Scholar

  • Callahan BJ, McMurdie PJ, Rosen MJ, Han AW, Johnson AJA, Holmes SP. DADA2 : inférence d’échantillons haute résolution à partir des données d’amplicon Illumina. Méthodes Nat. 2016 ; 13 : 581–3.

    Article du CAS Google Scholar

  • McMurdie PJ, Holmes S. phyloseq : un package R pour une analyse interactive reproductible et des graphiques des données de recensement du microbiome. PLoS ONE. 2013 ; 8 : e61217.

  • Garcia-R JC, Ogbuigwe P, Pita AB, Velathanthiri N, Knox MA, Biggs PJ, et al. Premier signalement de nouveaux assemblages et d’infections mixtes de Giardia duodenalis dans des isolats humains de Nouvelle-Zélande. Acta Trop. 2021 ; 220 : 105969.

  • Liu L, Fang R, Wei Z, Wu J, Li X, Li W. Giardia duodenalis induit l’apoptose dans les cellules épithéliales intestinales via la voie mitochondriale médiée par les espèces réactives de l’oxygène in vitro. Agents pathogènes. 2020 ; 9 : 1–14.

    Google Scholar

  • Abdel-Moein KA, Saeed H. Le potentiel zoonotique de Giardia intestinale assemblage E en milieu rural. Parasitol Res. 2016 ; 115 : 3197–202.

    Article Google Scholar

  • Brynildsrud O, Tysnes KR, Robertson LJ, Debenham JJ. Giardia duodenalis chez les primates : classification et spécificité d’hôte basée sur l’analyse phylogénétique des données de séquence. Zoonoses Santé Publique. 2018 ; 65 : 637–647.

    Article du CAS Google Scholar

  • Seabolt MH, Konstantinidis KT, Roellig DM. Diversité cachée au sein des parasites protozoaires communs révélée par un nouveau schéma de génotypage. Appl Environ Microbiol. 2021 ; 87 : 1–17.

    Article Google Scholar

  • Sinha R, Abu-Ali G, Vogtmann E, Fodor AA, Ren B, Amir A, et al. Évaluation de la variation du séquençage des amplicons de la communauté microbienne par le consortium du projet Microbiome Quality Control (MBQC). Nat Biotechnol. 2017 ; 35 : 1077–86.

  • Hornung BVH, Zwittink RD, Kuijper EJ. Enjeux et normes actuelles de contrôle dans la recherche sur le microbiome. FEMS Microbiol Écol. 2019 : 95:45.

    Article Google Scholar

  • England R, Harbison S. Examen de la méthode et validation du MiSeq FGxMT Solution de génomique médico-légale. Wiley Interdiscip Rev Forensic Sci. 2020 ; 2 : e1351.

  • Knox MA, Garcia-R JC, Ogbuigwe P, Pita A, Velathanthiri N, Hayman DTS. Absence de Cryptosporidium hominis et prédominance des zoonoses Cryptosporidium espèce chez les patients après les restrictions de Covid-19 à Auckland, en Nouvelle-Zélande. Parasitologie. 2021 ; 148 (11) : 1288–92.

  • Leave a Comment