Éclosion de Covid 19 Omicron : la Nouvelle-Zélande a sa propre lignée génétique de sous-variante

L’épidémie d’Omicron en Nouvelle-Zélande est désormais dominée par plusieurs lignées BA.2 génétiquement liées à notre pays, ce qui reflète l’étendue de la propagation et de l’évolution de la sous-variante ici.

Un scientifique de l’ESR dit
il est probable que notre profil de variante changera à nouveau lorsque les frontières rouvertes amèneront encore plus de formes d’Omicron à se répandre aux côtés des nôtres.

En quelques mois seulement, les scientifiques ont observé le sous-type original BA.1 d’Omicron submerger la variante Delta – avant que les niveaux de BA.1 ne soient également écrasés par le BA.2 à propagation plus rapide.

Le responsable de la bioinformatique et de la génomique d’ESR, le Dr Joep de Ligt, a déclaré que l’analyse génomique d’échantillons de Covid-19, principalement de cas prélevés à notre frontière et dans les hôpitaux, a montré que BA.2 continuait de circuler “presque exclusivement”.

“Et cela a donné naissance à BA.2.10 – une lignée locale dominée par les cas néo-zélandais dans les données internationales.”

Mais ce n’était pas inattendu, a-t-il dit, et a souligné le fait que le virus avait suffisamment muté en se propageant ici pour se ramifier en “clades” de virus génétiquement différents.

“Le fait que la Nouvelle-Zélande voit maintenant ces choses signifie que nous avons ce que nous appelons des chaînes de transmission persistantes qui permettent au virus d’accumuler ces mutations”, a-t-il déclaré.

“Nous pouvons maintenant également voir un BA.2.10.1 – qui est la prochaine édition sur cette ligne.”

Il a souligné que les changements génétiques n’avaient pas rendu le virus – responsable de 5745 autres cas communautaires aujourd’hui et lié à 13 décès supplémentaires – encore plus transmissible ou grave.

Pour l’instant, il a déclaré que les cas de BA.2 non liés à nos clades étaient rarement détectés, tandis que le cas le plus récent de Delta a été séquencé en mars.

“Les données mondiales nous indiquent que Delta est maintenant signalé à zéro pour cent – il semble donc que les variantes d’Omicron l’ont supprimé à un tel niveau qu’il devient indétectable”, a-t-il déclaré.

“Cela ne signifie pas qu’il n’y a pas de cas Delta qui se promènent, mais simplement qu’il est dépassé par toutes ces autres sous-variantes.”

Les infections par les sous-variantes très médiatisées BA.4 et BA.5, quant à elles, étaient jusqu’à présent confinées aux cas frontaliers.

“Parce que BA.4 et BA.5 semblent avoir un léger avantage sur BA.2, il se peut qu’il soit déplacé, tout comme BA.1 l’était”, a-t-il déclaré.

“Mais étant donné que ceux-ci n’ont été établis que dans quelques pays, il s’agit toujours d’attendre et de voir.”

En Afrique du Sud, les deux nouvelles sous-variantes sont soupçonnées d’avoir multiplié par six le nombre de cas au cours des dernières semaines – mais il n’était pas clair si cela était dû à une immunité décroissante ou si ces sous-types étaient mieux à même d’échapper à l’immunité. ou infecter les gens.

Le week-end dernier, les autorités ont signalé le premier cas confirmé de BA.5 en Nouvelle-Zélande – un voyageur d’Afrique du Sud – mais ont insisté sur le fait que les paramètres de santé publique déjà en place pour gérer BA.2 étaient également appropriés pour gérer les autres types d’Omicron.

“La bonne nouvelle est que BA.4 et BA.5 ne semblent pas non plus être plus sévères à ce stade – et bien qu’ils puissent avoir un petit avantage, il est peu probable que nous les voyions soudainement conduire un deuxième gros faites signe ici.”

Les modélisateurs s’attendent à ce que la prochaine poussée de la Nouvelle-Zélande – peut-être dès la fin de l’hiver – se produise à la suite d’une diminution de l’immunité contre la vaccination, l’infection ou les deux.

Avec peut-être jusqu’à trois millions de personnes déjà infectées, il est peu probable que sa trajectoire soit aussi dramatique que la première vague d’Omicron.

Une variante révolutionnaire entièrement différente d’Omicron pourrait-elle arriver avant cela ?

“Ce sont toujours des prédictions très dangereuses à faire : nous n’avons qu’à revenir sur la façon dont certaines personnes disaient que Delta serait la dernière variante, et que le virus avait épuisé son aptitude”, a déclaré Ligt.

“Il s’agit d’un virus qui n’existe chez l’homme que depuis deux ou trois ans maintenant, et il s’adapte toujours à nous en tant qu’hôtes, ainsi qu’aux vaccins et à l’immunité.”