Un facteur de risque génétique de rupture d’anévrisme intracrânien

L’étude couverte dans ce résumé a été publiée sur medRxiv.org sous forme de prépublication et n’a pas encore été évaluée par des pairs.

Points clés à retenir

  • L’étude a identifié cinq loci génétiques indépendants avec une signification à l’échelle du génome pour la rupture d’anévrisme intracrânien (rIA). Parmi ceux-ci, un nouveau locus, FGD6, a été identifié qui n’avait pas été impliqué auparavant dans la biologie de rIA.

  • L’analyse de la charge génétique et la caractérisation fonctionnelle ont indiqué que la variation génétique du locus FGD6 contribue au risque de rIA avec une expression réduite dans le tissu artériel.

  • L’analyse de séquençage de l’ARN unicellulaire des cellules endothéliales et périvasculaires a montré l’expression de FGD6 dans les cellules neurovasculaires où des altérations de FGD6 altéraient l’identité et la fonction des cellules.

Pourquoi c’est important

  • L’étude a utilisé la génomique fonctionnelle pour découvrir les déterminants génétiques du risque de rIA. On pense qu’une forte composante génétique est impliquée dans l’anévrisme intracrânien (IA). Les résultats de l’étude ont découvert des locus génétiques jusque-là inconnus pour aider à la prévention, au diagnostic et au traitement des maladies.

  • Cette étude a utilisé des approches non biaisées à l’échelle du génome pour comprendre les déterminants génétiques de la physiopathologie de l’IA et du risque de rupture.

  • L’étude a identifié et caractérisé un lieu de risque jusqu’alors inconnu pour le rIA.

Étudier le design

  • Le portail de connaissances sur les maladies cérébrovasculaires a été utilisé pour obtenir une cohorte de 84 353 personnes issues de 24 études d’association pangénomique (GWAS) publiées. Parmi ceux-ci, 7843 avaient rIA et 76 510 étaient des patients témoins. Les participants étaient d’origine européenne ou est-asiatique.

  • L’étude a utilisé la génomique fonctionnelle et l’analyse de la charge génétique et a analysé les données des polymorphismes mononucléotidiques (SNP) pour caractériser les facteurs de risque génétiques.

Principaux résultats

  • L’analyse GWAS a identifié cinq locus génétiques indépendants d’importance pour rIA. Ceux-ci comprenaient CDKN2B, EDNRA, RBBP8, RP1 et FDG6. Parmi ceux-ci, le locus FGD6 n’avait pas été précédemment impliqué comme facteur de risque.

  • La charge mutationnelle au niveau du gène a été déterminée à l’aide de l’analyse SNP. Il a révélé que FGD6 était associé à 21 SNP et atteignait une importance à l’échelle du transcriptome.

  • La cartographie quantitative de l’expression des locus de traits a révélé que rs12310399 provoque une diminution de l’expression de FGD6 dans le tissu artériel.

  • Le séquençage d’ARN unicellulaire de cellules cérébrovasculaires humaines normales a identifié une expression élevée de FGD6 dans 1 des 3 lignées artérielles. Il a été démontré que FGD6 joue un rôle dans la régulation de l’angiogenèse et du réarrangement du cytosquelette d’actine.

Limites

Divulgations

Ceci est un résumé d’une étude de recherche préimprimée, “L’analyse génomique intégrative implique une diminution de l’expression de FGD6 sous-jacente au risque de rupture d’anévrisme intracrânien”, rédigée par des chercheurs du Département de neurosciences de l’Université d’Alabama à Birmingham et du Département de bioinformatique médicale de l’Université Vanderbilt. Medical Center, Nashville, Tennessee, publié sur medRxiv et fourni par Medscape. Cette étude n’a pas encore été évaluée par des pairs. Le texte intégral de l’étude est disponible sur medRxiv.org.

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